.CRAM 文件格式
文件类型 压缩对齐文件
CRAM是什么文件？
欧洲分子生物学实验室的分站EBI开发的压缩比对文件格式；存储从短读比对器（如BWA、BBMap和BLAT）生成的短DNA序列读取比对。
如何打开 .CRAM 文件
压缩对齐文件 是数据库或数据文件，需对应数据库软件或专用工具打开。
- 确认文件扩展名为 .CRAM，且文件已完整下载。
- 根据您的操作系统，参考下方分平台说明，使用推荐软件打开 压缩对齐文件。
- 若无需安装软件，可尝试 FileInfo 在线工具（如 文件格式识别）。
- 仍无法打开？使用 文件格式识别 检查扩展名是否与真实格式一致。
分平台打开方式
Windows
SQLite Browser、Access、MySQL Workbench 等（视格式而定）。
在线处理方式
可用文件格式识别确认类型；不要随意用文本编辑器修改二进制库文件。
- 文件格式识别 — 识别真实格式
- Magic Bytes 查询 — 文件头魔数对照
- MimeType 查询 — 扩展名与 MIME
- 文件哈希计算 — 上传文件算 MD5/SHA
常见问题
- .db 文件是什么？
- 常见于 SQLite 等嵌入式数据库，可用 DB Browser for SQLite 打开。
更多信息
CRAM文件格式类似于二进制对齐/映射（Binary Alignment/Map，BAM）文件格式，但具有更好的文件压缩和重新构造的面向列的二进制容器格式。随着遗传软件领域数据量的增加，CRAM格式被设计成减少对齐数据的磁盘脚印。
短读比对是破译基因组中序列来源的过程。这可能很困难，因为参考基因组相当大，你并不总是在参考基因组中寻找精确的匹配。短读对齐器用于搜索大量序列中的匹配项和接近匹配项。由于序列太大，为了保持文件大小的可管理性，CRAM等格式提供的压缩是必要的。
打开.CRAM文件的软件程序
最后更新：2020-02-08