.CRAM 文件格式
文件類型 壓縮對齊文件
CRAM是什麼文件?
歐洲分子生物學實驗室的分站EBI開發的壓縮比對文件格式;存儲從短讀比對器(如BWA、BBMap和BLAT)生成的短DNA序列讀取比對。
如何打開 .CRAM 文件
壓縮對齊文件 是數據庫或數據文件,需對應數據庫軟件或專用工具打開。
- 确認文件擴展名為 .CRAM,且文件已完整下載。
- 根據您的操作系統,參考下方分平台說明,使用推薦軟件打開 壓縮對齊文件。
- 若無需安裝軟件,可嘗試 FileInfo 在線工具(如 文件格式識别)。
- 仍無法打開?使用 文件格式識别 檢查擴展名是否與真實格式一緻。
分平台打開方式
Windows
SQLite Browser、Access、MySQL Workbench 等(視格式而定)。
在線處理方式
可用文件格式識别确認類型;不要随意用文本編輯器修改二進制庫文件。
- 文件格式識别 — 識别真實格式
- Magic Bytes 查詢 — 文件頭魔數對照
- MimeType 查詢 — 擴展名與 MIME
- 文件哈希計算 — 上傳文件算 MD5/SHA
常見問題
- .db 文件是什麼?
- 常見于 SQLite 等嵌入式數據庫,可用 DB Browser for SQLite 打開。
更多信息
CRAM文件格式類似于二進制對齊/映射(Binary Alignment/Map,BAM)文件格式,但具有更好的文件壓縮和重新構造的面向列的二進制容器格式。随着遺傳軟件領域數據量的增加,CRAM格式被設計成減少對齊數據的磁盤腳印。
短讀比對是破譯基因組中序列來源的過程。這可能很困難,因為參考基因組相當大,你并不總是在參考基因組中尋找精确的匹配。短讀對齊器用于搜索大量序列中的匹配項和接近匹配項。由于序列太大,為了保持文件大小的可管理性,CRAM等格式提供的壓縮是必要的。
打開.CRAM文件的軟件程序
最後更新:2020-02-08