.CRAM 文件格式

歐洲分子生物學實驗室的分站EBI開發的壓縮比對文件格式；存儲從短讀比對器（如BWA、BBMap和BLAT）生成的短DNA序列讀取比對。

CRAM文件格式類似于二進制對齊/映射（Binary Alignment/Map，BAM）文件格式，但具有更好的文件壓縮和重新構造的面向列的二進制容器格式。随着遺傳軟件領域數據量的增加，CRAM格式被設計成減少對齊數據的磁盤腳印。

短讀比對是破譯基因組中序列來源的過程。這可能很困難，因為參考基因組相當大，你并不總是在參考基因組中尋找精确的匹配。短讀對齊器用于搜索大量序列中的匹配項和接近匹配項。由于序列太大，為了保持文件大小的可管理性，CRAM等格式提供的壓縮是必要的。